顛覆了韓春雨的研究成果,蛋白質編輯技術重出江湖!

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遺傳編輯是利用靶向修飾來改造基因組的一種新技術。CRISPR/Cas9系統自發現以來已經成為基因組編輯庫中功能最強的工具之一。雖然CRISPR/Cas9系統得到了研究者的高度評價,但它也存在著一些缺陷。在CRISPR/Cas9系統中,幾種脫靶活性和目標識別的PAM需求限制了它在基因組序列中的應用。所以,尋找新的基因編輯方法仍是一個熱點問題。除Cas9蛋白家族外,還有Argonaute (Ago)蛋白家族的研究報告,包括TtAgo和PfAgo,也有一些基因編輯能力。

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Ago蛋白存在於原核與真核生物中。Ago蛋白是RNA誘導沉默複合物(RISC)的一個重要組成部分。在RNA干擾(RNAi)、microRNA和piRNA介導的轉錄後沉默中,真核生物Ago蛋白髮揮了重要作用。有些原核Ago蛋白,如TtAgo和PfAgo,能在gDNA的引導下誘導外源基因(外源質粒或噬菌體)降解。但是TtAgo和PfAgo通常在65℃左右起作用,這限制了它們在哺乳動物細胞中的應用。

有報告稱,古生菌(Natronobacterium gregoryi)的NgAgo蛋白與TtAgo和PfAgo具有高度同源性,能夠在37°C下誘導被短 DNA引導的目標DNA降解。但是,其他實驗室不能確認原論文報道的NgAgo-gDNA編輯 DNA實驗結果。毋庸置疑,NgAgo能降低目的蛋白的表達。但是,基因編輯活動很難捉摸,最初的研究表明對 DNA靶向進行基因編輯,而隨後的所有研究都只觀察RNA的基因編輯。

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一些研究表明,NgAgo能夠發揮 DNA引導內切核糖核酸酶的作用,靶向切割RNA。NgAgo-gODN系統可切割編碼人DYRK1A基因外顯子11的 RNA轉錄。另外一項研究表明NgAgo-gDNA系統可以有效地抑制乙肝病毒的複製,從而加速RNA的衰變。然而,他們的研究中並沒有確定切割位點。另外,NgAgo在gDNA互補序列中分散的位點切割 RNA,這一結果還未被其他研究證實。

2020年7月23日,華中科技大學羅迪賢與南華大學共同通訊在Molecular Biotechnology (IF=2。69)上公佈了名為Identification of a Novel Cleavage Site and Confirmation of the Effectiveness of NgAgo Gene Editing RNA Targets的研究論文。

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本文透過體外和體內兩種方法對NgAgoRNA進行了檢測。在此基礎上,設計了一套RNA體外切割系統,並對切割位點進行了驗證。本實驗還將NgAgo和gDNA轉染到細胞內的靶向序列。結果表明,NgAgo對 GFP、HCV、AKR1B10 RNA具有gDNA依賴性,但未觀察到對 DNA的影響。序列測定表明,5‘序列中的切割位點位於目標 RNA3’,並被識別。這證明了NgAgo-gDNA切割的是RNA而非DNA。切割部位位於目標RNA的3‘,這是過去未報道過的新發現。

正因為如此,韓春雨在河北科技大學NatureBiotechnology上發表了一篇研究論文,用Ago蛋白對基因組進行編輯。

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韓春雨事件時刻表:

今年五月八日,多家媒體以一鳴驚人為題,先後報道了韓春雨的論文成果;2016年5月27日,一篇文章聲稱沒有重複實驗的文章在一篇文章中出現了一篇關於韓春雨的文章成果的文章;2016年5月27日,一篇文章聲稱沒有重複實驗的文章。

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2016年7月21日,中科院神經科學研究所研究員仇子龍發表一份宣告,認為NgAgo能在基因組水平上對NgAgo基因進行編輯,並呼籲韓春雨儘快發行NgAgo2。0版和Smart版;2016年7月29日,澳大利亞科學家Gaetan Burgio發表長文,表示不能重複韓春雨論文中圖4的結果;2016年8月2日,澳大利亞科學家GaetanBurgio發表了一篇研究報告。本雜誌將按照既定的程式進行調查;8月9日,韓春雨應公益組織Addgene的要求,釋出了新的protocol產品。

6月10日,北京大學分子醫學研究所教授熊敬維,北京大學生命科學學院研究員孫育傑,中科院動物研究所研究員王育傑,中科院動物研究所研究員王育傑、李敬維等13位北京大學分子醫學研究所教授、北京大學生命科學系研究員孫育傑、中科院動物研究所研究員王育傑、中科院動物研究所所長王皓宇等13位科學家共同關注,並提出了一系列問題,並對此進行了澄清,並對此進行了澄清。

2017年1月9日,國家智慧財產權局於1月9日發出撤消申請通知書,表明生物科學與工程學院生命科學系副教授韓春雨與浙江大學基礎醫學系副教授沈嘯作為發明人的“撤銷申請”。

Nature Biotechnology在2017年5月9日線上發表了Editorial Expression of Concern(關注編輯部),指出期刊編輯部門已經注意到了讀者對韓春雨2016年5月2日在網上發表的關於NgAgo論文重複性的擔憂。

“Nature Biotechnology”於2017年8月3日發表一份宣告,撤銷韓春雨團隊2016年5月2日在該期刊上發表的論文。據報道,韓春雨主動要求撤回論文。

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10月31日晚,河北科技大學官方網站公佈了《韓春雨團隊撤稿論文的調查和處理結果》,該公告認為,這篇論文已不具備重新發表的基礎,在此基礎上未發現韓春雨團隊撤回論文。

顛覆了韓春雨的研究成果,蛋白質編輯技術重出江湖!

2019年9月1日晨,河北科技大學生物科學與工程學網站發表了《韓春雨關於撤回論文調查處理結果的宣告》。韓春雨表示道歉,並對學術界和社會各界對此表示感謝。