摘要:
化合物庫的核心引擎是化學結構搜尋,愛菩新開發的Molkit,為化合物庫管理新增核心引擎。
化學大資料需要更高效的結構搜尋服務
結構式搜尋是一種以輸入化學分子結構圖形為特徵的化學資訊搜尋方式,區別於CAS號,化學名稱等的數字或文字搜尋方法,是目前化學家在科研或訂購化學試劑時最常用的搜尋方式。化學結構搜尋主要包括全結構/精確搜尋,子結構搜尋和相似結構搜尋。
圖2
三種檢索方法示意圖
適用物件
1、高校、研發機構和藥企,化合物庫的儲存與檢索;
2、化合物供應商官網,相容多種瀏覽器,客戶透過結構搜尋找到目標化合物進行購買;
特色優勢
1、產品技術成熟,無需二次開發;
2、傻瓜式安裝,支援電腦瀏覽器管理、手機APP管理;
3、功能強大,支援化合物屬性檢索、子/全結構檢索、相似度檢索及以上方法的組合檢索。
4、 一次安裝,多應用支援。支援多個不同產品的api呼叫。
6分鐘實戰操作
場景1:線上編輯結構
小紅:“我想畫一個小分子結構。”
小明:“用
Molkit
內建化學編輯器,瞧,搞定啦,支援sdf、mol等格式的匯入匯出,也支援jpg等格式的圖片匯出。”
場景2:建立化合物資料庫
小紅:“小明,我最近分離了野菊花和三白草的成分,想管理這2種中藥的天然產物庫,有沒有什麼好方法。”
小明:“有的,用
Molkit
,
點選新增,新增化合物庫,批次上傳或單個錄入化學結構即可,瞧,兩步就搞定啦。”
小明:“小紅,
Molkit
還可以管理公共、私人或商業的更多化合物庫呢,像Drugbank、陶素分子庫、腫瘤免疫抑制劑、合成的AChE小分子抑制劑庫等,同時管理幾百萬個化合物不成問題。”
小紅:“這麼強呢 ! ! !”
場景3:全結構/精確檢索
小紅:“小明,我想看我的化合物庫裡有沒有青蒿素的化學結構?”
小明:“可以啊,4步搞定,選擇想檢索的庫,輸入青蒿素結構,選擇檢索方法,一鍵點選就搞定啦,當然你也可以新增多個庫,進行跨庫檢索呢。”
小紅:“哦,以前沒發現有兩個結構一樣呢,可以刪掉其中一個了。”
場景4:子結構檢索
小紅:“小明,我想查在Drugbank裡有多少個是苯茚子結構的藥物?”
小明:“是呀,同樣4步,先選擇需檢索的資料庫,然後輸入子結構,選擇子結構檢索方法,你看含苯茚結構的化合物有2個。”
場景5:相似度檢索
小明:“小紅,你在幹嘛?”
小紅:“小明你看,有2個化合物和我的小分子相似度高達80%,明天從庫裡取點做實驗。”
場景6:軟體安裝
小紅:“小明,用了這麼久,這個軟體怎麼裝?”
小明:“電腦端瀏覽器直接嵌入,手機端下載 APP安裝使用,聯絡愛菩新工程師微信/手機:18988821851,18928913950即可開通試用。”