還要說明，暗示彼得墓地的第一篇文字，是在使徒去世後一百多年寫下的。傳說是以時代更為靠後的資料為基礎的。這種經久不衰的傳說認定，聖彼得是在科爾納利亞街附近的尼祿馬戲場殉教的。這個馬戲場當時差不多就位於現今的聖彼得教堂和梵蒂岡。同一傳說還告訴我們，聖彼得是在同一天（或者只差一天）和聖保羅一起被處決的，即公元67年6月。

但是，後者是羅馬公民，所以只是被砍頭，而彼得是“普通的猶太窮人”，所以慘遭十字架酷刑。據說為了表示謙虛，他要求被釘死在十字架上時，不是像他的主人那樣頭朝上，而是頭朝下。人們從這裡就不難想象，庇護十二世心甘情願承擔的風險是多麼大。就算是第一批基督教徒事實上沒有可能在彼得死後去“收回”他的屍體；就算是基督教徒們只是到這個地方或者鄰近地方進行奠祭，而且只是建起了一個紀念碑，即按照勒南所理解的意義而建的加伊烏斯墓碑，但是，在挖掘教堂下的地層時，人們冒的第一個風險是：在聖彼得的墓地，也許只會挖出用以紀念使徒殉教的一塊石碑或墓碑短石柱。

第二個風險也是很大的：如果人們挖開使徒的墓，那有可能是一座空墓。在整個中世紀上半葉，羅馬不斷遭外來侵略。而梵蒂岡是在城牆外面，所以比聖城本身更容易遭到襲擊。公元416年，阿拉里克和他手下的西哥特人包圍了羅馬城。如果說，他們沒有毀掉康斯坦丁（5）在假想的聖彼得墓地上建設的教堂的話，那麼，至於公元455年的蓋塞裡克和他手下的汪達爾人，公元537年的維蒂蓋斯和他手下的東哥特人以及公元544年的託提拉，情況就不一樣了。

公元846年，撒拉遜人（6）取代了野蠻人。人們把聖·貝爾丹（7）年鑑同加羅馬國的政府公報混淆起來。聖·貝爾丹年鑑說，撒拉遜人將使徒之王墓地的祭壇連同名貴的裝飾品統統帶走了。公元993年，教堂遭大火。公元1527年，波旁王朝陸軍統帥下的德國僱傭軍又將教堂洗劫一空。面對無法更改的、重複出現的證據，難道人們還能期望所發現的並不是一座空墓？尤其重要的是，人們不禁要問，就算聖彼得的遺骨在一段時間裡曾在梵蒂岡儲存過，但是，這些遺骨會不會在3世紀運往別處去了呢？

有些考證專家認為，在公元258年這一年，那些有聖物癖的信徒突然有了前所未聞的發現。巴黎大學的基督教史教授、歷史學家吉爾貝爾這樣說明：“我甚至於在想，並不是在公元258年這一年，兩人的遺骸才被發現，而6月29日節最初可能就是紀念這一發現的……就好像聖徒傳記家所經歷的那樣，某種神靈的啟示使人們發現了聖物的藏地。而地下墓窟正是尋找貴重棺木的理想之地。

就算是遺骨不在棺木裡，但是，將棺木歸還給自己兄弟的基督教徒們總不會是騙子吧。他們只是對考證有愧，其實這算不了什麼。他們成了因虔誠而輕信這個弱點的第一批上當受騙者。”但不能輕易排除這一假設。於是人們終於認識到，公元258年是一個關鍵性的年頭。或者是在這一年，人們將聖彼得的遺骸從梵蒂岡轉移到地下墓窟，或者，更簡單地說，人們只是在地下墓窟“發現”了上述遺骸，而這些遺骸在公元313年之後，又移到了梵蒂岡。