提起長門大家可並不陌生，不僅僅因為長門是曉組織的人，更因為他操縱佩恩六道做了很多事情，還殺死了自來也老師。但是，長門也是可憐之人啊！

他是漩渦一族的後裔，“曉”的首領，繼半藏之後雨隱之村的新一任首領。擁有宇智波斑所給予的輪迴眼，是佩恩六道的操控者。原來是第二次忍界大戰雨隱村的孤兒，在認識小南和彌彥後跟隨自來也學習忍術。一生經歷了父母雙亡及彌彥之死兩大痛楚後，被宇智波斑也就是帶土蠱惑，決定在痛苦的輪迴中孕育和平。

第二次忍界大戰時期，兩名木葉忍者闖入長門家裡。誤以為長門的父母是敵人將其父母殺死。害怕的長門無意識開啟輪迴眼，將入侵者殺死。失去父母的長門從此過著流浪的日子…後來暈倒在路上被經過的小南救起，並把長門帶到了一個基地裡結識了彌彥，同為戰爭孤兒的三人決定相依為命。長大後的三人以彌彥為首創立了曉。立志不靠極端武力來創造世界和平，之後有許多人加入了這個組織，曉逐漸壯大並聲名鵲起。遠在木葉的自來也還偶爾聽到他們的戰鬥事蹟。中途宇智波帶土曾經找過長門，並試圖拉攏長門等人，但被長門和彌彥拒絕。半藏勾結團藏，在會談地點埋伏，參與抹殺他們三個的還有木葉的暗部。半藏以事先擒獲的小南的性命作要挾讓長門殺了彌彥，彌彥為了救小南讓長門殺了自己。

摯友彌彥死後，長門成為了曉的首領，並使用輪迴眼製出了屍體傀儡佩恩六道，彌彥的遺體被長門製作成為佩恩六道之中的天道佩恩，用來統率曉組織。天道與其他五道不同，對於長門來說是最重要的，是由好友彌彥的身體做成。長門並未把天道當成一個工具，而是以平等身份尊重，長門對天道說“你永遠是曉的首領”，彌彥生前就是曉的首領，即便是死了長門依舊讓他做“首領”。由此可見，彌彥對長門的影響之深。

第二次忍界大戰時期。小南在長門暈倒的時候給了長門一個麵包，然後把長門加上一條叫小不點的流浪狗帶到彌彥的秘密基地，從此彌彥、長門、小南在一起生活。為了改變戰亂不斷的國家，就開始尋找木葉三忍學習忍術，邂逅了三忍並索要食物，自來也給了他們餅乾吃。小南用餅乾紙折了一朵紙花，送給了木葉三忍，自來也就決定留下來照顧這三個孩子。三年後，自來也看到三個孩子已經可以獨立，就離開了他們。

在長門死後，在雨隱村內，小南遇到正在準備回收輪迴眼的“面具男”，並被索問輪迴眼所在。為了保護長門的遺體，小南與“面具男”戰鬥。“面具男”從背後出現用黑棒刺中了小南。小南奮力攻擊“面具男”，結果完全不敵。“面具男”對奄奄一息的小南發動幻術，得知了長門屍體所在，成功奪取輪迴眼，而小南則死去了。小南臨死前回憶了小時候三個人和自來也老師一同生活的往事，最後是帶著微笑死去的。

多年前，在他們三個還是孩子的時候，是彌彥和小南收留了成為孤兒的長門，讓長門有了依靠，有了親如家人的朋友，也是彌彥的提議，讓長門決定還是守護和平。雖然彌彥死了，長門也對這個世界失望透頂，但是，從鳴人和佩恩的戰鬥中，長門似乎明白了什麼，他覺得鳴人是有能力改變這個世界的。在那個世界，長門，彌彥和小南應該會像小時候一樣一直在一起吧！希望是那樣！