首先，北宋是亡於外族政權金國，而明朝是亡於內部農民起義，這就決定了南宋和南明政權的穩定性是不同的，直接影響了政權集權力量的強弱。

北宋雖亡，但是南方的統治根基健在，在趙構振臂一呼下，南宋建立，大一統帝國集權模式繼續開啟，整個南方的軍政大權都牢牢的掌握在了皇帝和中央手中，再加上民心向宋，南宋又佔據了長江天塹的地理優勢，在擁有絕對經濟實力的情況下，是具備和蒙古帝國打持久消耗戰的條件。

在後來的南宋滅亡歷史經驗教訓中，蒙古帝國透過掠奪逐漸壯大，而南宋因戰爭經濟蕭條，加之宰相賈似道改革失敗，致使南宋經濟崩潰，無法有效地彌補軍事上的弱勢，更無法組織起大規模防禦力量，導致了襄樊之戰的失利，從而南方門戶洞開，直到崖山海戰南宋滅亡。

南明就沒有南宋那麼好的條件了，明末的積重難返最直接的表現在了財政上，沒有錢就沒有了中央權威，就使喚不上各地總兵平叛，導致李自成兵臨北京城下猶如入無人之境，崇禎的死也是一種自我解脫，千瘡百孔的明帝國連修理的錢都沒了。

崇禎死後，明帝國實質上已經是解體狀態了，不是流民政權就是軍閥擁兵自重，儘管重建了南明的半壁江山，但實際控制力很小很弱，南明政權的基層組織結構已有垮塌之勢，內部也是明爭暗鬥不休，皇帝的權力常常受到軍閥和文官掣肘，難以集中財力、軍力抗衡精銳的八旗清軍。

另外，值得一提的是，南宋雖然軍事弱，也只是縱向的比歷朝歷代顯弱，在當時來看，亞歐大陸能抵擋蒙古帝國幾十年不滅的政權，也就只有一個南宋了，南宋的守城戰和水戰曾經屢屢讓蒙古軍損失慘重鎩羽而歸。

南明的軍隊，除了鎮守在遼東的邊軍戰力強悍，內地的正規軍戰鬥力跟流民武裝差距不大，南明軍隊和八旗軍不是一個等級的對手，所以清軍有壓倒性的軍事力量。

相比較南宋，南明的底子太差，整個國家系統是一種混亂的狀態，即便沒有外族入侵，也差不多會亡於內。

而南宋卻恰恰相反，國家經營有道，經濟發展迅猛，階級矛盾相對緩和，如果沒有外族入侵，可能延續的時間會更久。