從整個中國歷史來看，儒家的影響要遠遠超過道家，道家思想只是得意於一時，而儒家思想則幾乎統治了中國整個封建社會，成為中國2000多年封建社會政治的主導思想，小編本次要講的就是司馬遷的政治思想。
成長於這一歷史長河中的司馬遷，不可能不受這種儒家思想的影響。但是，這並不等於說他的思想就是屬於儒家的。這也要做一番具體的分析。在這裡首先要弄清楚的，就是先秦儒與秦漢儒的區別，以及司馬遷對這兩種儒學的態度。在司馬遷看來，先秦儒與秦漢儒有霄壤之別。先秦儒的真精神是不媚世俗，矢志不移地堅持儒道，這突出地表現在孔子弟子所述孔子之言的《論語》以及司馬遷的《孔子世家》中。
孔子終其一生，東奔西走，不能得志，但窮而不改其道。這裡僅舉一例說明：孔子及其弟子厄於陳、蔡，陳、蔡用事大夫發徒卒圍孔子於野，孔子一行不得行，糧絕，從者病，可以說是到了山窮水盡的地步，而孔子泰然自若，講誦絃歌不衰。這時，有的弟子對孔子之道有些動搖，提出懷疑，如子貢認為：“夫子之道至大也，故天下莫能容夫子，夫子蓋稍貶焉？”
孔子則認為：“君子能修其道，綱而紀之，統而理之，而不能為容。”並批評子貢其志不遠。顏回倒是能理解孔子之道，說：“夫子之道至大，故天下莫能容。雖然，夫子推而行之，不容何病，不容然後見君子！夫道之不修也，是吾醜也。夫道既已大修而不用，是有國者之醜也。”孔子極為讚賞，欣然而笑因為顏回道出了他的心聲。孔子至死也堅持不改其道，不願稍貶而用之於世。
且不說孔子之道如何，孔子的這種精神則是相當感人的，人格是相當崇高的。到了秦漢之際，一些儒學之士則拋棄了這種精神，不惜降低標準，降低人格，阿世求容，追求利祿。秦漢時博士叔孫通則是典型一例。在秦時，他便阿二世意，進言陳勝起義是“此特群盜鼠竊狗盜耳”，不足憂，得到二世讚賞。可見，秦之滅亡，亦有他的一份“功勞”；投奔漢高祖後，同弟子一起“起朝儀”，“面諛得以親貴”。
漢武帝時的公孫弘之流，亦是典型的阿世求容的人物，他唯皇帝之言是聽，常常改變自己的主張，為人外寬內忌，因而得到漢武帝賞識，位至三公，封為平津侯。秦漢儒之與先秦儒，有著本質的不同。司馬遷對先秦儒與秦漢儒，其態度是涇渭分明的。對先秦儒，他是十分推崇的，列孔子為世家，號為“至聖”，在其世家中說：“中國言六藝者折中於夫子。”並在其他篇目中書孔子之生卒、事蹟。
誠如清代學者趙所說：“孔子無公侯之位，而《史記》獨列於世家，尊孔子也。凡列國世家與孔子毫無相涉者，亦皆書是歲孔子相魯、孔子卒，以其系天下之輕重也。”司馬遷還把孔子的言論作為評判歷史人物、是非的標準。有人統計，在《史記》中引用孔子的話或融會孔子的語意來評論人物、評論是非的有130多處。他還對孔子六藝作了高度評價。《史記》就是繼《春秋》而作。
用孔子作《春秋》的精神、目的來作為自己撰史的指導思想，當然在承繼的基礎上有所創新和發展。而對秦漢儒，司馬遷是鄙薄和批判的。他在《史記中一再申說有純儒、雜儒之分，有小人儒、君子儒之分，而雜儒、小人儒則指那些秦漢之儒。他所記敘的一些歷史人物常常對漢儒大不敬，稱之為“豎儒”、“腐儒”、“愚儒”、“酃儒”，等等。這雖然不是司馬遷直接發論，但多少代表了他的思想和看法。
司馬遷寫《儒林列傳》，並不是完全推崇儒學，為儒家樹碑立傳，而主要是記載秦漢之儒阿世求祿的行徑，並表明自己的看法。他在是傳一開頭便說：“餘讀功令，至於廣厲學官之路，未嘗不廢書而嘆也。”接著寫孔子修六藝，弟子繼之，“成遵夫子之業而潤色之，以學顯於世”；秦朝滅亡之後，“六藝從此缺焉”；漢武帝即位後，舉儒者公孫弘白首為三公，“天下之學土靡然向風”，“公卿大夫士吏斌斌多文學之士”。
對此，方苞在《書儒林傳後》中曾評論說：“子長序《儒林》，…蓋嘆儒術自是而變也。……其以文學為官，始於叔孫通弟子以定禮為選首，成於公孫弘請試士於太常，而儒術之汙隆，自是而中判矣。…而弘之興儒術也，則誘以利祿，而日以文學禮義為官，使試於有司，以聖人之經為藝，以多通為能通，而比於掌故。由是儒之道汙，禮義亡。…子長所讀功令，即弘奏請之辭也。自孔子以來群儒相承之統，經戰國、秦漢，孤危而未嘗絕者，弘乃以一言而敗之。
由弘以前，儒之道雖滯，而未嘗亡；由弘以後，儒之途通，而其道亡矣。此所以廢書而嘆也。”這種分析是比較中肯、深刻的。司馬遷還寫這些儒者為了阿世取容，將儒學和酷法融為一體，儒生、酷吏相為推引，結果朝廷雖是多文學之士，實際上多是酷吏之士。在《遊俠列傳》中，他每每將秦漢儒與先秦儒對照起來寫，於秦漢儒則多譏。他說：“至如以術取宰相卿大夫，輔翼其世主，功名俱著於春秋，固無可言者。”
很明顯地看出他對秦漢儒的譏諷態度。由上可見，司馬遷對儒學不能籠統地說是推崇還是反對，而是對先秦儒相當稱道，對秦漢儒則予以批判，對先秦儒的推崇，實際是反襯了對秦漢儒的譏刺；而對秦漢儒的批評，則又表明了對先秦儒的嚮往。當然，他對先秦儒中孔子的推崇，並不是推崇他的不顧現實，意孤行，而是推崇他的精神、道義、為人。他要繼承先秦儒的積極精神，而要擯棄秦漢儒棄道求祿的庸俗行為。
小編認為基於以上分析，可以看出，司馬遷對儒家、道家均有所吸收，有所批判，吸收兩家的長處，而去其兩家的短處，比較主張儒道合流，儒道合一。那種簡單地認為司馬遷的政治思想是屬於儒家還是道家的說法，都是片面的，不夠科學和準確的。