1520年10月，教皇下詔書，勒令馬丁路德在60天之內悔過自新，否則將開除他的教籍，路德面對威逼利誘毫不動搖，在擁護者的讚美聲中把教皇的詔書付之一炬。

路德的反抗行動進一步劃清了自己同教會的界限，同時也極大地鼓舞了德意志和西歐各國的人民，他們更加崇敬路德，也更加嚮往宗教改革。可以說由路德點燃的宗教改革之火在西歐各國已成燎原之勢。面對這種可怕的局面，教皇有些慌了手腳，只好一再教促德皇查理五世為路德定罪。德皇終於決定於1521年4月17～26日，在沃爾姆斯召開帝國會議，為路德定罪，給這樣一個叛經離道的叛逆者以懲誠。路德並沒有被教皇的淫威嚇倒，他昂首挺胸地到達沃爾姆斯，在帝國會議上據理力爭，毫不讓步。

查理五世、教皇等一幫人無計可施，只好蠻橫地對路德進行人身迫害，宣佈路德為不受法律保護的人。路德無法立足，只好隱居到瓦特堡，從事聖經翻譯。路德並沒有沉寂下去。他選擇的聖經翻譯工作有著不可估價的積極意義。1522年9月，路德翻譯出版了德文聖經，它使廣大人民可以很容易地看到聖經，使聖經不再為教士所專有，人民可以憑藉自己的理解來解釋聖經了。路德的宗教改革得到了一些諸侯和下層人民的支援，廣大的人民群眾在宗教改革運動的推動下行動起來。他們不只是反對羅馬教皇和教會的壓榨，並開始起來反抗大封建主的壓迫，在德國爆發了大規模的農民戰爭。

一些封建諸侯趁農民戰爭之機奪取了教會的財產，他們為保護自己的既得利益多數支援路德的宗教主張，並在他們領地內建立了新的教會。1529年，路德編寫了《教義問答》。1530年在奧格斯堡帝國議會上，路德委託梅蘭希頓起草了公開綱領《奧格斯堡信條》。這個信條成為路德教的基本綱領和信仰宣告。此後，路德又發表了一些著作，進一步闡述了自己的宗教主張，如15355年的《施馬爾卡登信條》、1538年的《論教會會議與教會》等。但路德不能代表人民。當德國農民要把宗教改革變成一場推翻現存剩削制度的政治革命時，路德退縮了，最後走向背叛，成為世俗統治者的代言人。

他先寫了《勸基督徒勿從事叛亂書》又開始回維登堡講道，平息騷亂，最後寫了《反對殺人越貨的農民暴徒書》。他對待農民起義的態度由勸撫、調解到力主鎮壓。路德教在德國蛻變成為世俗諸侯的工具。以路德為代表的市民階級溫和的宗教改革運動，僅在宗教形式上進行了一些改革。1546年2月，路德死於出生地艾斯勒本，享年63歲。155年，德國皇帝與新教諸侯締結了《奧格斯堡和約》，規定教隨國定，使路德教最後得到確認。路德一生功過參半。他所發起並領導的宗教改革運動席捲整個歐洲，水久性地結束了羅馬天主教會對於西歐的封建神權統治。

丹麥、瑞典成為最先公開接受路德教的國家，在其他國家路德教也有很多信徒。他的宗教學說為新興資產階級提供了革命的思想武器。恩格斯認為路德是他那個時代的巨人，他無愧於這一光榮。