南明政權應該是不算明朝，或者說南明已經不能代表明朝政權，南明政權嚴格意義上都不能算作“政權”。但是可以認為明朝殘餘勢力。從法理傳統上，南明算明朝，因為明朝政治延續就在南明。但是從國家層面，南明算偽朝。

南明可以看做是明亡後的一個地方朝廷，但不能和主流明朝歷史混為一談。李自成入北京後，明朝在全國的根基就已經毀了。南方建立的南明只能說是眾多勢力的一股，只是和明皇室有著血統上的關聯而已。這個勢力七零八落的存在了十幾年，當然也有說存在了四十幾年。

歷史上像南明這種情況還有很多，比如南北朝時候南朝梁滅亡後出現的西梁、遼朝以後的西遼、元朝以後的北元，都不能算正統的前一個朝代。南明情況與以上地方朝廷相同，不能算作正統的明朝。

公元1644年，清軍擊敗了李自成的起義軍，趁勢入主中原。而當時的明朝皇帝早已死，國都也被落入清朝滿人手中。南明政權也是在此種情況的建立了。然而中國歷史與之相似的朝代有東晉和南宋。如果仔細對比的話，我們可以發現這兩個朝代的疆土基本上是整個南國，但最重要的是這兩個朝代的疆土均相當穩定，國防力量也逐漸由稀鬆走向完備，起碼可以維持疆土相對穩定，此外兩者的皇帝傳承也相對的穩定（儘管東晉皇帝被架空，存在被廢的厄運，但司馬氏在相當長的時間仍是南北士族的共主）。

相反，我們發現南明政權是個稀鬆的拼湊，幾方勢力共存，朱姓皇族自立山頭。確實南明初期的疆域和軍隊都非常大，但它沒有統一的指揮，基本處於散沙狀態，最基本的國防也就談不上了，也就不能稱之一國。

因為，一個政權的不是說你宣佈成立了，歷史就必須認可你。他是有一定標準的，地域、人口，組織機構，政治目標，等等。基礎的標準，也是最根本的標準是穩定的年代。如果一個政權總是處在風雨飄搖之中，或者東奔西跑、流寇式的狀態，是不會被承認的。

在南明苟延殘喘的幾十年裡，南明基本上沒有形成任何有效的地域治理和政權體系，僅僅是一個簡陋的團體執著的進行著最後的抗爭，這種抗爭與明朝的關係已經不是太大了。

一個王朝的滅亡，是以國土淪喪，軍隊瓦解，政權體系崩潰為標識。在李自成進入北京，紫禁城裡眾大臣做鳥獸散，偌大的皇宮只有崇禎主僕二人，絕望的崇禎皇帝煤山自盡的那一天，明朝就已經實際上完結了，至於是李自成接管天下還是最終滿清入關接管天下，這些都已經與明朝無關了。

其實，不僅僅明朝是這樣，西漢滅亡成立“王莽政權”，那時候劉邦的“漢”就已經滅亡了，後來劉秀的“東漢”並不是僅僅“定都”的區別，實際上那是另一個王朝。北宋和南宋也是一樣。