三藩的軍隊雖然只佔清代初年全國兵力的十分之一左右，但其兵將受到藩王多年豢養，都帶有家兵性質，且久經戰陣，戰鬥力頗強。
藩王除了額兵之外還私自徵兵，並給府中成年男子發放兵器，經常操練。因而三藩軍隊的戰鬥力是不可小視的，所以清軍在平叛戰爭中常遭敗績。儘管如此，康熙帝卻能夠巧妙分化叛軍，使吳三桂外援盡失，陷於孤立，並迫使其放棄長沙，退走衡陽，而以失敗而告終。
清朝在處境不妙的情況下，為何能夠一舉擊敗吳三桂？
一、康熙剿撫並用的策略
孫延齡反叛後，康熙為阻止叛亂勢力的蔓延，迅速作出軍事調整：授副都統根特巴圖魯為平寇將軍，率兵開赴廣東作為平南王尚可喜的援兵共同阻止叛軍勢力向東蔓延；命鎮南將軍尼雅翰、都統朱滿、巴爾布等率兵由武昌水陸並進奪取嶽州、長沙、直入廣西；
命平南王尚可喜與兩廣總督金光祖、廣西提督馬雄協力討伐叛軍。
這些軍事上的部署隨著形勢的發展而有所調整，以適應戰爭的需要。在武力圍剿的同時對叛軍進行招撫。
定藩原藩主孔有德為清朝統一立下汗馬功勞，清朝獲得全國統治權他功不可沒。朝廷對孔有德也是獎勵有加。孔有德殉難後，朝廷更是將他對清朝的忠誠大肆宣揚，把他定位成國家的忠烈之士。
清廷對孔四貞是恩寵有加，並將她封為格格，是定藩名義上的藩主。
後來的掌權人的夫人，她對朝廷的懷有感恩之心及與朝廷的關係，多多少少影響到將士們的對清廷的效忠心理。
清廷利用定藩與朝廷這樣的關係，多次在詔諭中提到：“念其（孫延齡）所管官兵，系定南王舊人，受恩累朝，忠義素著，必不甘心從逆，隳棄前勳”，“其所官人員及地方官兵，有能夠擒斬孫延齡投獻軍前者，優加爵賞；或以兵馬城地納款者，論功敘錄；
或力有不逮，能自拔來歸者，亦免罪收用”，“孫延齡雖叛，其所部兵，曾隨定南王效力，國家豢養有年，恐大兵到日，概行誅戮，朕心有所不忍”。
對孫延齡的討伐鎮壓亦改為“改過來降，亦從寬宥”。馬雄和線國安相繼投靠叛軍後，康熙也極力爭取他們投降：“今特頒專敕宣諭，爾等果翻然悔悟，棄逆效順，將爾已往之罪，並所屬官吏，悉行赦免。若能剿寇立功，仍加恩優恤。”
康熙透過招撫政策來動搖軍心，從而分化叛軍勢力。
二、團結漢官
從皇太極到康熙，歷任統治者都十分注意籠絡漢族官員，重視他們的作用，也注意提高他們的地位，從而爭取到漢族官員的對清朝的支援。
清王朝從關外起，就重用明末降清的范文程、洪承疇、孔有德、尚可喜、耿仲明等人，封以高官顯爵，賜予重祿厚俸，使他們竭誠為清王朝進取中原賣力。
除了封爵厚賞以外，還宣佈科舉取士，大力網羅知識分子。
順治時推行尊孔崇儒，提倡封建道德，樹立傳統道德捍衛者的形象，從而清除廣大漢族人民對清統治者心理上的隔閡。熙除了在政府內重用漢人，廣開仕路，在意識形態上標榜崇尚儒家道統之外，還十分勤奮地學習儒家學說和傳統的典章制度，並舉行徑筵大典，令翰林院的講官們由隔日進講改為每日一講，與熊賜履、湯斌等人從容討論儒學的治道，探討施行仁政的辦法。
正是在這樣的政策下，如著名學者黃宗羲前期堅持抗清，在他晚年就稱康熙為“聖天子”，要他的學生們擁護清代的統一。
清廷努力維護國家安定統一和弘揚中華傳統文化的做法，贏得了漢族官員的衷心擁戴和全力支援，因而在平叛戰爭中才會有漢族官員的誓死效忠。
例如，廣西巡撫馬雄鎮寧死不降，傅弘烈的英勇奮戰和寧死不屈。
康熙團結漢官的政策“不僅使一些尚未公開表示支援吳三桂的人服從他的命令，而且還能使大部分曾經背離朝廷的人也重新站到他這一邊來”，是平叛戰爭獲得勝利的重要因素之一。
三、廣西各族人民對平叛戰爭的擁護和全力支援
廣西在歷經明末苟捐虐政的破壞後，清初又是兵禍連年，桂林成為南明永曆政權駐地和瞿式耜、大西軍李定國抗清鬥爭的中心，戰禍連綿，廣大人民遭受無盡苦難，社會生產遭到嚴重破壞。
各族廣大人民需要安定的社會局面來休養生息，恢復生產，發展社會經濟。
統一和安定是廣大人民的共同要求。
早在孫延齡開始叛亂時，巡撫馬雄鎮就指出：“廣西人民不甘從逆”。對於早已過著安寧生活的人民來說，根本不願意再受戰亂之苦。所以孫延齡參叛後，他的部將士兵們也隨著戰爭的繼續逐漸產生了反叛情緒，他們多次拒絕北上協助吳三桂作戰；馬雄叛亂後，他母親“欲令其孫承先持書赴廣西招降”，都說明了人心所向。
傅弘烈前往桂、滇、黔少數民族地區招募義勇組建平叛軍隊時，得到各族人民的熱烈支援，很快就有五千人應徵。傅弘烈的軍隊在軍餉不足、裝置較差、人數不夠的情況下，屢戰屢捷，在於他的軍隊得到各族人民的支援。
傅弘烈率領廣西各族人民平定叛亂的事蹟，說明廣西各族人民和全國人民一樣堅決要求祖國統一，反對分裂叛亂。
四、從全國範圍來看，吳三桂的叛亂也是遭到人民群眾反對的
吳三桂製造分裂，屠殺人民，違背全國人民意志，得不到人民群眾的支援，也得不到絕大多數漢族官員將士的支援。“天下士夫皆有望治之心，並無從亂之意。
逸民遺老，亦早已痛恨三桂之，尤無人贊助藩變者。”以反清著稱的思想家王夫之堅決拒絕為吳三桂寫當皇帝的“勸進表”，寧願隱居深山，也不肯為三藩做事。
吳三桂雖以復明為號召，但是大多數漢人仍然忠於清朝：直隸、山東、河南、安徽等地無人反應，江南、西南的響應者則是少數社會上層人士；在廣大的人民、下層兵士中，不僅沒有出現順治年間那種轟轟烈烈的抗清景象，相反斥責三藩搞分裂的呼聲愈益高漲。
如康熙十五年尚之信反清時，廣東人民就堅決反對，並斷言廣東三年後依舊歸清朝。
原來支援三藩叛亂的鄭經，這時也察覺出吳三桂等人的狼子野心。康熙十五年，他在發動對耿精忠的戰爭時，指責吳、耿說：“我在海外數十年，奉稱明號。今吳稱周，耿稱甲寅，是以來攻。……爾家皆我敵國也”。
就連顧炎武這樣一位堅定的明朝忠臣也不能寬恕吳三桂先前的背叛。
吳三桂“在明亡明，事清叛清”的形象遭到人民的厭惡。
這充分說明，吳三桂為分裂祖國、稱帝割據而進行的反清活動，破壞國家統一，是違揹人民意願和歷史潮流的。各族人民對叛亂則深惡痛絕，他們看穿吳三桂裂土稱帝的面目，一致聲討他們發動的這場反動戰爭。
連遠居北方的察哈爾、科爾沁等蒙古部都主動請求派出兵馬討伐吳三桂；
清軍入滇時，雲南各族熱烈歡迎中央政府的軍隊，“所在棵苗（彝族）皆仰慕”，紛紛下山“輸饋糧糗”，“鄉導前驅”，由此可見三藩的叛亂毫無社會基礎。
康熙以堅定的平叛決心和傑出的軍事才能，領導平叛戰爭取得勝利。
但是勝利最根本的原因還是在於平叛戰爭的正義性，在於得到人民群眾的擁護和支援。恩格斯說到歷史人物的動機背後的動力時，有這樣一段話：“與其說是個別人物，即使是非常傑出的人物的動機，不如說是使廣大群眾，使整個整個的民族，以及在每一民族中間又使整個整個階級行動起來的動機”。
正是全國各族人民要求統一，反對分裂的鬥爭是實現和鞏固國家統一的根本力量。全國人民要求和平安寧、反對戰爭的強烈意志，以及在長達八年的戰爭中，各族人民和軍隊奮勇作戰討逆，南方和西南各省人民積極支援平叛大軍，這是戰爭取得勝利的最重要因素。
各族人民平定三藩叛亂戰爭的勝利，從根本上說是正義力量的勝利。
吳三桂等人發動的叛亂，目的在於搞分裂割據，得不到人民群眾的支援，失敗是必然的。
而清朝平定叛亂則是維護國家的統一，符合人民的願望和利益，能得到各族人民群眾的支援。任何分裂主義者，不管打著何種旗幟，開始時勢力有多大，喊出什麼蠱惑人心的口號，最終必敗。
五、總結
康熙在平定三藩之亂過程中，排程全域性，以湖南為主線，以江西、浙江為東線，陝西、甘肅、四川為西線，各戰場相互配合，逐漸佔據了戰爭的主動權。
康熙自始至終親自參加了平叛戰爭的全盤指揮，且指揮得當，又嚴格軍紀、賞罰分明，在驛遞之外每四百里置筆帖式保證了軍報的及時傳遞。
同時他分化瓦解、剿撫並用的策略，重視對叛軍將士的招撫；重視發揮漢人的作用；注意保衛重要財賦地區為平叛戰爭提供有效的經濟保障等。
廣西平叛戰爭的勝利除了戰略上的運用得當，還有各族人民對平叛戰爭的支援。