元朝是我國曆史上初次由少數民族樹立的大一統王朝，控制者為蒙古孛兒只斤氏。定都大都（今北京），傳五世十一帝，從1206年成吉思汗樹立蒙古政權始為162年，從忽必烈定國號元開端歷時98年。元朝退出中原後的北元政權一向持續到1402年。1368年，朱元璋樹立明朝，隨後北伐驅趕元廷佔領大都。爾後元廷退居漠北，史稱北元。1402年，元臣鬼力赤篡奪政權樹立韃靼，北元消亡。

殘元政權的消亡

1368年，享國運不足百年的元朝被朱元璋領導的起義推翻了，與遼、金、西夏等少數民族政權不同，末代皇帝元順帝妥歡帖睦爾既沒有戰死，也沒有自殺，而是率領著王族和所剩的戎行撤退到了自己祖先曾經鼓起的故地——蒙古高原，在我國完成了一次外來政權全身而退的“奇觀”。這得歸功於從成吉思汗開端的近似於瘋狂的擴張，使得蒙古帝國幅員遼闊，汗國、部落樹立，而元朝的地圖只算蒙古帝國的一部分，元朝的皇帝又是蒙古帝國的大汗，關於蒙古各大汗國和部落享有宗主權。元朝的消亡，僅僅使蒙古帝國失去了我國的疆域，而蒙古帝國依然存在。元順帝是元朝皇帝中罕見的觸控漢文化較深的一個，大都凹陷慌亂北歸的衝擊，關於他來說是極大的，儘管依然仍是蒙古各部的大汗，但也不能排解他“去國懷鄉”的憂慮，尤其是明朝戎行關於他的持續衝擊又接連不斷，更使他惶惶不可終日。總算，1370年5月23日，他懷著悲憤和鬱悶，在沙拉木倫河畔的應昌逝世。元順帝的兒子愛猷識裡達臘獲悉父親逝世的訊息後，便在哈拉和林繼位，他將殘元政權又維持了八年，並厲兵秣馬盼望著有朝一日重登我國皇位。1378年，愛猷識裡達臘懷著滿腔惋惜逝世，其子脫古思帖木兒繼位，這位第三任殘元皇帝所能控制的疆域現已縮小到蒙古帝國最初鼓起時的規模，恢復祖上的榮光更顯得毫無或許了。1388年，一支10萬人的明朝戎行在大將藍玉的率領下在合勒卡河和克魯倫河之間、貝爾湖南岸大敗脫古思的戎行，殘元諸王、平章以下官員三千多人及軍士七萬餘人被俘，脫木思帖木兒逃走後被其部將縊殺。

群雄紛起爭汗位

殘元的消亡，使明朝失去了政治上的敵人，蒙古現已成為了“邊患”，而不再是前一王朝殘餘實力。因而，永樂皇帝關於貴力赤表明了極大的友好，承認了他關於蒙古各部的宗主權。可是，貴力赤也並沒有保持汗位有多久，便在1400年被阿蘇特部領袖阿魯臺和衛拉特部領袖馬哈木的聯軍打敗。阿蘇特部是蒙古化了的伊朗人，起源於高加索，因蒙古西征而進入我國，元朝戎行中有一支由他們組成的軍團。而衛拉特部是森林蒙古人中的一個強大的部落，在成吉思汗時代被稱為“林木中百姓”，定居在貝加爾湖西岸。阿蘇特部和衛拉特部關於蒙古中部和東部控制都沒能長久，貴力赤之子額色庫重新崛起，要與阿魯臺和馬哈木搶奪大汗寶座，雙方進行了十幾年的戰役，直到額色庫於1425年病死。永樂皇帝親身率軍進入蒙古，直抵成吉思汗故地——鄂嫩河上游平原，於1410－1411年擊退了本雅失裡和阿魯臺的戎行。這次失利對本雅失裡來說是致命的，因為這使他喪失了作為大汗的威望。1412年，衛拉特部領袖馬哈木乘機將他打敗，奪取了汗位。

黃金宗族的復辟

在衛拉特人實力削弱的時分，成吉思汗後嗣們並未立刻組織反攻，因為他們正在宗族戰役中互相殘殺。1467年，成吉思汗的第27代承繼人滿都古勒大汗在討伐他的侄孫和承繼人博勒呼濟農的一次戰役中逝世。而博勒呼濟農在他能夠稱汗之前的1470年也被暗殺。一度人丁興旺的黃金宗族中，現在僅剩下一個5歲的男孩、博勒呼濟農之子達延。達延的命運及其不幸，宗族的老一輩都在內訌中死去，小小的孩子孤苦無依，連他的母親都拋下他改嫁了，這簡直比成吉思汗年幼時的遭遇還要悲涼。所幸，滿都古勒汗的年青遺孀滿都海賽音可敦把他置於自己的保護之下。滿都海賽音可敦是一個了不起的女性，她不光撫養了達延，還在1470年宣佈他為大汗。最為可貴的是，滿都海賽音可教作為女性率領戎行打敗了衛拉特人，將他們徹底趕出了蒙古中東部地區。為達延汗日後的控制奠定了基礎。達延汗是蒙古帝國控制時刻最長的大汗，從1470年到1543年整整73年。

蒙古帝國的消亡

儘管達延汗的長期控制穩定了蒙古帝國汗位傳承，但並沒有克服蒙古民族的最大缺點——實施分割宗族遺產的習慣法。當帝國的建立者死後，帝國便成了一種相似聯邦式的宗族國家，國內的各級領袖，都是兄弟或堂兄弟，他們儘管承認察哈爾部的最高權力，但處於適當的獨立狀況。1604年，林丹承繼汗位，接受黃教沙爾巴呼圖克圖的灌頂戒教，稱林丹庫圖克圖汗。林丹汗並不是一個糊塗無能的可汗，他早已看出後金帝國關於蒙古的野心，因而上從繼位始，便開端從新統一各部，自稱“統領四十萬眾蒙古國巴圖魯青吉斯汗”。1627年派兵降服右翼鄂爾多斯、喀喇沁、土默特等部，與喀爾喀部卻圖汗結為聯盟，聲威大振，所轄地域東起遼東，西至甘肅。可是，次年，朵顏兀良哈的蘇布臺、喀喇沁的達來臺吉、土默特和布石圖汗、額爾多斯的額仁沁濟農以及永謝布、阿蘇惕、阿巴嘎、喀爾喀等部聯合組成大軍十萬，在土默特的召城一戰中，消耗了林丹汗精銳軍力四萬餘人，這使得林丹汗的實力大為削弱，而他的敵人是歸納了蒙古人的彪悍和漢人的謀略的後金皇帝努爾哈赤和皇太極，這就註定只有勇猛而少策略的他只能失利。1632年4月，皇太極再率大軍西進，多爾袞從徵。至西拉木倫河畔，會集蒙古諸部兵，共擊林丹汗。面臨實力遠勝自己的敵軍，林丹汗無奈自歸化城驅人畜十萬渡黃河西逃。但面臨現已大勢已去的大汗，部眾十之七八在途中散去。林丹汗逃奔青海，兩年後在青海打草灘病死，他臨死前，或許會和明朝的末代皇帝崇禎相同，哀嘆“朕不是亡國之君！”，他們都盡力過了，可是他們的才能都無法使他們重現祖上的榮耀。明帝國和蒙古帝國爭鬥了兩百多年，誰也沒能消除對方，最後，在相差不到10年時刻內，先後被滿清所滅。1635年，多爾袞與嶽託等領兵萬人渡河，招降林丹汗部眾於額哲，林丹汗的妻子和兒子歸降，交出可汗印信，整個漠南蒙古完全納入了後金帝國的地圖，蒙古帝國的汗位至此斷絕，而蒙古帝國，也永遠的消失了