人體的胃腸道是如何消化食物的呢？食物透過人的口腔進入到胃裡，此時胃就會分泌出大量的胃蛋白酶，而食物就會在胃裡高濃度的酸性環境下進行初步的消化，食物中的一些營養物質同時被胃吸收。

經過胃部的初加工後的食物接下來就會進入到小腸裡進一步消化，為了讓進入到小腸裡的食物得到充分消化，小腸的裡可是擁有非常豐富的酶系統，除了小腸自身會分泌許多酶蛋白和小腸粘液外，胰臟分泌的胰酶、肝臟分泌的膽汁等其他不同種類的酶也都會集中在小腸裡，去幫助在小腸鹼性環境裡的食物能得到進一步消化吸收。這樣食物中的營養物質則會被小腸更充分的吸收。

不過，小腸裡雖然充分消化吸收了這些初加工的食物的營養，但這些經過消化吸收的食物對人體內環境來說，依然會被當做是一個有害的異物。為了避免我們身體誤吸收了這些食物中含有的有害物，此時此時小腸腸壁下的大量免疫組織就會發揮作用避免我們人體誤吸收。

看到這裡，相信細心的讀者一定會發現一個疑點，胃的內環境是強酸性，而小腸的內環境怎麼又是鹼性環境呢？而且在強酸強鹼性的環境下，微生物還會存活嗎？答案是肯定的，比如在強酸性胃部環境裡就生存著幽門螺桿菌，這類細菌就喜歡在強酸性的環境下生存，而且目前已有大量科學證明胃癌的發生和幽門螺桿菌有很大的關係。那小腸呢？當然也存在一些少量微生物，雖然食物經過胃腸道消化酶的作用下消滅了一部分細菌，但仍有少部分的細菌殘留在小腸裡，這些細菌主要集中在小腸和大腸交接的部位。相比胃和小腸的內環境，大腸的內環境就有些複雜，除了各種各樣的細菌，食物殘渣也會集中在大腸裡，可以說大腸是細菌和食物垃圾共存的環境。這又是為什麼呢？

當食物中大部分營養物質被小腸吸收後，剩餘的食物殘渣就會進入大腸裡，生活在大腸環境中的微生物菌群會將食物殘渣中所含有極少量的營養物質進行吸收，但同時一些有害的營養物質也會被吸收進去。如果有害物質吸收過多，就會對我們的健康產生不良影響。而且不同的微生物菌群所產生的代謝物也會對人體造成不同的影響。究竟會造成哪些影響呢？想要解開這些謎團，就得認識大腸內環境的微生物菌群。